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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Ecologia de Ambientes Aquticos Continentais

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Ttulo [PT]: Avaliao da seqncia nucleotdica do gene mitocondrial citocromo oxidase I na identificao de espcies de peixes neotropicais.
Ttulo [EN]: Evaluation of the nucleotide sequence of cytochrome oxidase I gene in the neotropical fish species identification.
Autor(es): Vivian Nunes Gomes
Palavras-chave [PT]:

Peixes de gua doce. DNA barconding. Sistemtica molecular. Gene mitocondrial citocromo oxidase I (COI). mtDNA. Taxonomia. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Freshwater fishes. Cytochrome oxidase I gene (COI). mtDNA. DNA barcoding. Taxonomy. Brazil.
rea de concentrao: Cincias Ambientais
Titulao: Mestre em Cincias Ambientais
Banca:
Alberto Jos Prioli [Orientador] - Nuplia/UEM
Alessandra Valria de Oliveira - Centro Universitrio de Maring (Cesumar)
Weferson Jnio da Graa - UEM
Resumo:
Resumo: DNA barcoding foi definido como metodologia padro para quantificar a biodiversidade global atravs do polimorfismo molecular. Como tomada de deciso para identificao das espcies, foi estipulado um limiar de 10X entre variao intra-especfica e interespecfica. Para isso, foi selecionado o gene mitocondrial citocromo c oxidase I (COI) em animais. A comunidade ictiofaunstica da regio neotropical considerada a mais diversa, com alto nmero de espcies endmicas e taxa crpticos. Para auxiliar na minimizao do impedimento taxonmico e na identificao das espcies de peixes para a regio neotropical, o critrio de DNA barcoding foi avaliado quanto efetividade em discriminar pares de espcies prximas com descries taxonmicas consistentes. Foram analisados fragmentos de aproximadamente 535 pb de 20 pares de espcies pertencentes a sete gneros. As anlises foram conduzidas baseadas no modelo de substituio Kimura-2-Parmetros e algoritmo neighbor-joining. Houve compartilhamento de hapltipos entre indivduos de duas espcies do gnero Potamotrygon e tambm entre alguns indivduos de duas espcies de Schizodon. As mdias de distncias genticas intra-especficas e interespecficas variaram de 0 a 0,3% e 0,3 a 16,8%, respectivamente. Treze pares de espcies obtiveram valores de diversidade gentica suficientes para serem identificadas pela sequncia COI. Os pares de espcies dos gneros Potamotrygon (P. falkneri e P. motoro), Pseudoplatystoma (P. reticulatum e P. punctifer), Salminus (S. brasiliensis e S. hilarii), Steindachnerina (S. brevipinna e S. insculpta) e trs espcies de Schizodon (S. borellii, S. intermedius e S. fasciatus) no atingiram o limiar estipulado pelo projeto, consequentemente no foram diferenciados pela sequncia COI. Pode-se inferir que o sistema microgenmico de identificao para peixes da regio Neotropical deve ser utilizado com cautela para no subestimar a biodiversidade. Estudos de sistemtica e taxonomia que contemplem todo o arcabouo possvel de informaes sobre a espcie em estudos podem contribuir de maneira mais efetiva na minimizao do impedimento taxonmico.

Abstract: DNA barcoding was defined as a standard methodology for quantifying the global biodiversity through a mitochondrial gene portion cytochrome c oxidase I (COI). As decision making for species identification, a threshold of 10X between variation intra-specific and interespecific was stipulated. The neotropical fish community is considered the most diverse with high number of endemic species and cryptic taxa. In order to help minimizing the taxonomic impediment and identification of fish species of neotropical region, the criterion of DNA barcoding was evaluated regarding the effectiveness in distinguishing pairs of close species with consistent taxonomic description. Fragments of approximately 535 bp from 20 species assigned in seven genera were analyzed. The analyzes were conducted based on the Kimura-2-Parameter distance model and neighbor-joining algorithm. There were similarities between species congeneric haplotypes of Potamotrygon and Schizodon. The average genetic distances intra-specific and interespecific varied from 0 to 0.3% and 0.3 to 16.8%, respectively. Thirteen pairs of species obtained values of genetic diversity enough to be identified by the COI sequences. One pair of species of the genera Potamotrygon (P. falkneri e P. motoro), Pseudoplatystoma (P. reticulatum e P. punctifer), Salminus (S. brasiliensis e S. hilarii), Steindachnerina (S. brevipinna e S. insculpta) and three species of Schizodon (S. borellii, S. intermedius e S. fasciatus) not reached the threshold stipulated by the project, consequently were not differentiated by COI sequence. It is possible to conclude that the microgenomic identification system for fish of Neotropical region must be used with caution to avoid an underestimate the biodiversity and discrimination work of species involving information in various areas may help to minimize the taxonomic impediment.
Data da defesa: 09/02/2011
Cdigo: vtls000185242
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2011
Local de Publicao: Maring
Orientador: Prof. Dr. Alberto Jos Prioli
Coorientador: Dr. Carla Simone Pavanelli
Instituio: Universidade Estadual de Maring. Departamento de Biologia
Nvel: Dissertao (mestrado em Ecologia de Ambientes Aquticos Continentais) / UEM. Programa de Ps-Graduao em Ecologia de Ambientes Aquticos Continentais

Responsavel: salete
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: Gomes-Vivian N-2011-ME.pdf
Tamanho: 970 Kb (993209 bytes)
Criado: 30-05-2011 10:55
Atualizado: 15-09-2011 14:33
Visitas: 2390
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