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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

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Ttulo [PT]: Potencial do RAPD e de microssatlites para estimar distncias genticas em milho pipoca (Zea mays L.)
Autor(es): Ausileide Alves Leal
Palavras-chave [PT]:

Milho-pipoca (Zea mays L.). Divergncia gentica. Microssatlites (marcador molecular). RAPD (marcador molecular). Distncia gentica. Melhoramento gentico. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Popcorn. Zea mays. Molecular markers. Brazil.
rea de concentrao: Gentica e Melhoramento
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Claudete Aparecida Mangolin [Orientador] - UEM
Cleso Antnio Patto Pacheco - Embrapa
Carlos Alberto Scapim - UEM
Resumo:
Resumo: A proposta do presente trabalho foi utilizar os marcadores moleculares RAPD e loci SSRs para estimar e caracterizar a divergncia gentica entre 10 linhagens endogmicas S7 de milho pipoca e avaliar a consistncia das informaes obtidas com o emprego destes dois marcadores. O aproveitamento de primers para RAPD foi de 10,84%. Com os nove primers selecionados, foram produzidos 126 fragmentos amplificados; destes 22 foram monomrficos e 104 foram polimrficos conferindo um polimorfismo de 82,54% para as 10 linhagens avaliadas. Dentre os 51 pares de primers de microssatlites testados, 14 foram selecionados, conferindo um aproveitamento de 27,4%. O polimorfismo para as 10 linhagens, avaliado com os 14 primers de microssatlites, foi de 52,76%. O nmero de alelos por locus de microssatlites para as 10 linhagens de milho pipoca variou de dois a cinco, com um total de 47 alelos para todos os primers usados. O nmero mdio de alelos por locus foi 3,36. O polimorfismo de DNA, detectado para as linhagens de milho pipoca analisadas no presente estudo, pode ser considerado alto, uma vez que, utilizando os 9 primers para amplificar sequncias aleatrias, a proporo de sequncias polimrficas foi igual a 82,54%, e utilizando os 14 primers para loci SSR foi possvel estimar um valor de heterozigosidade mdia esperada igual a 52,76%, um dficit de heterozigotos igual a apenas 4,5%, e uma diferenciao entre as linhagens de 73,49%. O valor de correlao de Pearson foi de 0,5453 demonstrando que a associao entre os marcadores positiva. Os dendrogramas construdos com os agrupamentos dos gentipos avaliados em funo das distncias genticas, estimadas a partir da anlise dos loci SSR e das sequncias de RAPD, mostraram agrupamentos similares formando dois grandes grupos. Desta forma, apesar das indicaes de que os. microssatlites correspondem a marcadores moleculares mais informativos do que as anlises de RAPD, as anlises das 10 linhagens de milho pipoca no presente estudo indicaram que ambas as tcnicas podem fornecer informaes consistentes e no mesmo sentido para estudar a diversidade gentica em milho pipoca, apresentando valores e diversidade e de distncias genticas concordantes.

Abstract: Molecular markers RAPD and SSRs loci have been empbyed to estmate and characterize the genetic divergence between 10 S7 endogamic popcorn strains and evaluate the consistency of information from the above-mentioned markers. Primers efficiency for RAPD reached 10.84%. One hundred and twenty-six amplified primers were produced from the nine selected primers. Since 22 and 104 were respectively monomorphic and polymorphic, an 82.54% polymorphism was established for the 10 strains evaluated. Whereas 14 out of 51 primer pairs of tested microsateilites have been selected and established a 27.4% efficiency, polymorphism for the 10 strains evaluated with 14 primers of microsateilites amounted to 52.76%. Number of alieles per microsateilite loci for the 10 popcorn strains ranged between 2 and 5, totaling 47 alieles for ali primers used. Mean number of alieles per locus was 3.36. DNA polymorphism detected for analyzed popcorn strains may be high since the proportion of polymorphic sequences was 82.54% when the 9 primers to amplify randomized sequences were used. Rate of expected mean heterozygosity was 52.76% when the 14 primers of SSR loci were employed. This fact revealed a heterozygote deficit of a mere 4.5%, coupled to a 73.49% differentiation between strains. Since Pearson?s correlation rate was 0.5453, association among markers was positive. Dendrograms made up of genotype groupings evaluation according to genetic distances and estimated from SSR loci analysis and RAPO sequences showed similar groupings which formed two great groups. In spite of the fact that there are indications that microsateilites correspond to molecular markers which are more informative than RAPD analyses, current analyses of 10 popcorn strains indicate that both techniques may provide consistent and unequivocal information for the study of genetic diversity in popcorn, coupled to an agreement in diversity rates and genetic distances.
Data da defesa: 18/12/2008
Cdigo: vtls000185797
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2008
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Claudete Aparecida Mangolin
Instituio: Universidade Estadual de Maring. Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)/
UEM: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Responsavel: inez
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: tese AUSILEIDE.pdf
Tamanho: 759 Kb (776838 bytes)
Criado: 11-04-2012 10:26
Atualizado: 11-04-2012 13:12
Visitas: 794
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