Biblioteca Digital da UEM: Sistema Nou-Rau
Pgina Principal  Portugus   English  Español   Aumentar Texto  Texto Normal  Diminuir Texto
  Principal | Apresentao | Objetivos | Instrues Autores | Estatsticas | Outras Bibliotecas Digitais
  Sistema Integrado de Bibliotecas - SIB / UEM
Entrar | acessos | verso 1.1  
ndice
Pgina principal
Documentos
Novidades
Usurios

Aes
Consultar
Procurar
Exibir estatsticas

Procurar por:
Procura avanada

Dvidas e sugestes


Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Incio > Dissertaes e Teses > Cincias Agrrias > Agronomia > Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Ttulo [PT]: Diversidade gentica em prognies de milho doce utilizando marcadores SSR
Autor(es): Jacinto Vagner Rupp
Palavras-chave [PT]:

Milho doce (Zea mays). Diversidade gentica. Marcadores SSR (microsatlites). Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Sweet maize. Microsatellites. Genetic diversity. Brazil.
rea de concentrao: Gentica e Melhoramentos
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Maria de Ftima Pires da Silva Machado [Orientador] - UEM
Adilson Ricken Schuelter - COODETEC
Carlos Alberto Scapim - UEM
Resumo:
Resumo: A proposta do presente estudo utilizar os primers de SSR (Seqncias Simples Repetidas de DNA), conhecidos tambm como microsstelites, previamente isolados de milho comum para selecionar aqueles mais adequados para amplificar seqncias de microssatlites no DNA das prognies do cultivar de milho doce sugary-1 (su1). Os produtos das amplificaes devem informar sobre a diversidade gentica do material em estudo, sobre a estrutura gentica das populaes de linhagens que esto sendo formadas, e sobre a distncia e/ou similaridade entre as linhagens avaliadas. Dentre 100 primers testados, 13% foram polimrficos. Os 13 primers polimrficos (umc1071, umc1636, umc1736, umc1506, umc1582, umc1383, umc2080, umc1446, umc1590, umc1241, umc2343, umc1169, e umc2116) foram usados para investigar a diversidade gentica em 15 prognies de milho doce (W-06, W-07, W-10, W-12, W-16, W-17.1, W-22, W-26, W-28, W-30, W-36, W-37, W-17.2, W-46, e W-49), por determinar bandas bem definidas no gel e por apresentar alelos diferentes. Os primers umc2116 e umc1383 evidenciaram 2 e 3 alelos em 73,33% e 66,66%, respectivamente, das prognies, e o primer umc1582 foi o menos polimrfico. Um excesso de gentipos heterozigotos no locus Umc2116 pode ser constatado nas prognies W-12, W-28, W-26, W-46, W-30, e W-17.2. As freqncias de alelos distribudas de acordo com o esperado pelo equilbrio de Hardy-Weinberg, foram verificadas em 21.53% dos testes feitos nas 15 prognies. A prognie W-26 apresentou o maior nmero de loci polimrficos (92,31%) e o maior nmero de alelos por locus polimrfico. A prognie W-06 no apresentou polimorfismo, e as prognies W-12, W-17.1, e W-10, foram as que apresentaram a menor proporo de loci SSR polimrficos (23,08%). A prognie W-46 apresentou a maior proporo de gentipos heterozigotos observada (Ho = 0,3385), e a prognie W-28 apresentou a maior proporo de gentipos heterozigotos esperada (He = 0,3368). A ausncia de polimorfismo nos 13 loci SSR da prognie W-06 e os valores altos e baixos para a proporo de loci polimrficos e heterozigosidades observada e esperada nas diferentes prognies, determinam uma diferenciao gentica muito alta entre as 15 prognie sul na gerao S5 (FST = 0,6515). Desta forma, possvel concluir que o processo de seleo para a formao destas 15 prognies su1 de milho doce tem conduzido formao de prognies altamente diferenciadas para os 13 loci SSR analisados. O valor positivo para o coeficiente FIS indica um excesso de 4,36% de gentipos homozigotos na gerao S4. O nvel de divergncia gentica mostra a formao de trs agrupamentos principais onde as prognies esto distribudas num intervalo de similaridades ou identidades (I) genticas de 0,2085 a 0,8716. As prognies W-17.1 e W-26 so as mais similares (I = 0,8716) e as prognies W-37 e W-49 so as mais divergentes geneticamente (I = 0,2085). Os valores estimados para a identidade gentica entre as prognies podem ser teis para direcionar cruzamentos promissores, para selecionar a caracterstica de interesse mantendo, ou ampliando a diversidade gentica em loci, que em princpio, so considerados neutros, como os loci SSR.

Abstract: DNA Simple Sequences Repeated (SSR) primers, also known as microsatellites, previously isolated from common maize, were employed to select the most adequate one for the amplification of microsatellite sequences in the DNA of sweet maize, cultivars sugary-1 (su1). Amplification products inform the genetic diversity of the material under analysis, the genetic structure of developing progenies, populations and the distance and/or similarity between evaluated progenies. In the context of 100 primers, 13% were polymorphic (umc1071, umc1636, umc1736, umc1506, umc1582, umc1383, umc2080, umc1446, umc1590, umc1241, umc2343, umc1169, and umc2116) and used to investigate the genetic diversity in 15 strains of sweet maize (W-06, W-07, W-10, W-12, W-16, W-17.1, W-22, W-26, W-28, W-30, W-36, W-37, W-17.2, W-46, and W-49) through the determination of well-defined bands in gel and through the existence of different alleles. Primers umc2116 and umc1383 showed 2 and 3 alleles, respectively in 73.33% and 66.66% of strains; primer umc1582 was the least polymorphic. Excess of heterozygous genotypes in locus umc2116 has been pinpointed in strains W-12, W-28, W-26, W-46, W-30, and W-17.2. Frequency of alleles distributed according to Hardy-Weinberg equilibrium has been verified in 21.53% of tests in 15 progenies. W-26 had the highest number of polymorphic loci (92.31%) and the greatest number of alleles per polymorphic locus. Strain W-06 failed to present any polymorphism, whereas strains W-12, W-17.1 and W-10 had the least proportion of polymorphic loci SSR (23.08%). Strain W-46 had the highest proportion of heterozygous genotypes (Ho = 0.3385), while strain W-28 showed the highest proportion of expected heterozygous genotypes (He = 0.3368). Absence of polymorphism in 13 SSR loci of strain W-06 and high and low rates for the proportion of polymorphic loci and heterozygosity found and expected in the different strains determined a high genetic differentiation among the 15 su1 progenies in generation S5 (FST = 0.6515). It may be concluded that the selection process for the formation of the 15 sul strains of sweet maize has led towards the formation of highly differentiated strains for the analyzed 13 SSR loci. Positiveness for coefficient FIS indicates an excess of 4.36% of homozygous genotypes in S5 generation. Genetic divergence level shows the formation of three main groupings in which progenies are distributed in intervals of genetic similarities or identities (I) from 0.2085 to 0.8716. W-17.1 and W-26 are the most alike (I = 0.8716), whereas W-37 and W-49 are genetically the most divergent (I = 0.2085). Estimated rates for genetic identity among progenies may be useful for promising crossings, for the selection of interest characterization while keeping or amplifying the genetic diversity in the loci, as a rule neutral, such as SSR loci SSR.
Data da defesa: 11/07/2008
Cdigo: vtls000195589
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2008
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Maria de Ftima Pires da Silva Machado
Instituio: Universidade Estadual de Maring. Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)/
UEM: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Responsavel: inez
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: cm-jvrupp.pdf
Tamanho: 363 Kb (371772 bytes)
Criado: 16-04-2012 09:18
Atualizado: 16-04-2012 09:23
Visitas: 977
Downloads: 20

[Visualizar]  [Download]

Todo material disponvel neste sistema de propriedade e responsabilidade de seus autores.