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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Agronomia

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Ttulo [PT]: Uso da viso computacional para medio de crescimento fngico
Autor(es): Julio Cesar Tocacelli Colella
Palavras-chave [PT]:

Agroinformtica. Viso computacional. micologia. Bioinformtica. Fungos. Eventos biolgicos, Informtica aplicada agricultura. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Agroinformtica. Computer vision. mycology. Bioinformatics. Fungi. Biological events, Informatics applied to agriculture. Brazil.
rea de concentrao: Proteo de Plantas
Titulao: Doutor em Agronomia
Banca:
Joo Batista Vida [Orientador] - UEM
Ktia Regina Freitas Schwan Estrada - UEM
Dauri Jos Tessmann - UEM
Antonio Carlos Loureiro Lino - UEM
Marcelo Giovanetti Canteri - UEM
Resumo:
Resumo: Atualmente existem poucos trabalhos na rea da viso computacional voltados bioinformtica ou agroinformtica sendo quase obrigatria a utilizao de material bibliogrfico de reas correlatas. A bioinformtica uma linha de pesquisa que envolve aspectos multidisciplinares e iniciou na utilizao de ferramentas computacionais para a anlise de dados genticos. Estudos do comportamento de microrganismos, como o crescimento micelial, vm sendo empregando basicamente rguas para quantific-lo, ignorando outras metodologias. Na fitopatologia, a informtica tem sido mais frequentemente utilizada na epidemiologia de doenas de plantas. Sistemas de Viso Computacional em medies sem contato so especialmente teis quando se tm objetos pequenos ou de geometria complexa, nos quais instrumentos convencionais no podem ser utilizados. O objetivo principal deste trabalho foi medir eventos biolgicos que a viso no consegue captar, no caso, crescimento fngico, utilizando ferramentas computacionais, como a viso computacional. Para cada espcie fngica foram preparadas tabelas, com a medio executada empregando paqumetro (mtodo tradicional), com a medio usando a viso computacional por meio de rgua digital e de rea baseado na limiarizao de Otsu a cada 12 horas. O mtodo da viso computacional limiarizada apresentou-se adequado para medio de crescimento fngico e constitui numa tcnica vivel, apresentando maior preciso para medio de crescimento micelial de fungos quando comparado aos mtodos da rgua digital e do paqumetro. Tambm foi verificada uma superestimao de rea de colnia micelial quando empregados os mtodos da rgua digital e do paqumetro.

Abstract: In this area of computer vision there are very few studies about bioinformatics or even directed to agrocomputing, therefore, it becomes almost mandatory the use of bibliographic material related to areas such as biology, medicine and physics, as an example. Concerning the study of the behavior of microorganisms, particularly pathogenic, "in vitro", or also called vegetative growth, there aren?t also many studies related to mycelial growth, what turns the present material into some kind of source for the already published works. The Bioinformatics is a line of research involving multidisciplinary aspects which arose from the moment that the use of computational tools for the analysis of genetic data, biochemical and molecular biology has started. The agrocomputing - coined term to refer to information technology applied to agriculture - has gained space and becoming more and more organized, while in the field of plantpathology computer technology has been frequently used in the epidemiology of plant diseases. Computer Vision Systems in non-contact measurements are especially useful when dealing with small objects with complex geometry, for which conventional instruments cannot be used. The main objective of this work is to measure biological events as fungal growth, for example, which are not able to be captured by natural vision, but through computational tools such as computer vision. For each fungus were set up tables, with the measurement performed by the traditional way, every 12 hours, with another measurement using computer vision by digital ruler every each hour and, also, a junction table of both ones, turning the computer measurements into 12-hour measurements. The method of computer vision proved to be appropriate for measuring fungal growth and is a technique for easy operation, with greater accuracy for measuring mycelial growth of fungus when compared to the methods of the ruler and digital caliper. There was algo found an overestimation of the area of mycelial colony when methods of rule and the digital caliper were used.
Data da defesa: 21/03/2012
Cdigo: vtls000204747
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2012
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Joo Batista Vida
Coorientador: Prof. Dr. Ktia Regina Freitas Schwan Estrada
Instituio: Universidade Estadual de Maring. Programa de Ps-Graduao em Agronomia
Nvel: Tese (doutorado em Agronomia)/
UEM: Programa de Ps-Graduao em Agronomia

Responsavel: zenaide
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: COLELLA JCT.pdf
Tamanho: 4987 Kb (5107018 bytes)
Criado: 19-11-2014 11:29
Atualizado: 19-11-2014 13:10
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