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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

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Ttulo [PT]: Estrutura gentica de amostras de mandacaru usando locos heterlogos de microssatlites
Ttulo [EN]: Genetic structure of samples of mandacaru using heterologous loci microsatellite.
Autor(es): Vanessa Neves de Azevedo Fernandes
Palavras-chave [PT]:

Cereus peruvianus Mill. (cactaceae). Mandacaru. Diversidade gentica. Microssatlites. Variabilidade gentica. Transferibilidade. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Cactus. microsatellite and transferability. Brazil.
rea de concentrao: Gentica e Melhoramento
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Claudete Aparecida Mangolin [Orientador] - UEM
Maria de Ftima Pires da Silva Machado - UEM
Rogrio Fernandes de Souza - UEL
Resumo:
Resumo: Cereus, gnero de cacto ornamental conhecido como mandacaru, cultivado em jardins e reservas, com importncia ecolgica, econmica e industrial, devido diversidade de compostos que produz. O objetivo do trabalho foi estimar a transferibilidade de marcadores microssatlites de outras espcies de cactceas para mandacaru e com eles analisar a diversidade gentica para estabelecer relaes de similaridade ou divergncia gentica entre as diferentes amostras cultivadas nas regies Nordeste, Sul, Sudeste e Centro Oeste do Brasil. Para a seleo de marcadores microssatlites, foram avaliados 33 pares de primers, desenvolvidos para diferentes espcies de cactceas. Dessa avaliao, foram selecionados 10 pares de primers desenvolvidos a partir de Polaskia chichipe, Ariocarpus bravoanus, Astrophytum asterias e Echinocactus grusonii, obtendo uma transferibilidade de 30,30% para o mandacaru. Dois dos primers analisados forneceram informao para 2 locos. Foram avaliados doze locos heterlogos de microssatlites em 21 amostras de mandacaru. O polimorfismo mdio para as amostras foi de 58,33%; os locos avaliados apresentaram 31 alelos, com mdia de 2,58 alelos por loco. A anlise das frequncias genotpicas indica distoro na segregao para 68 locos e suas frequncias no apresentam distribuio de acordo com o equilbrio de Hardy-Weinberg. O valor mdio de Fis (0,0407) indica dficit de heterozigotos para os locos estudados. A frequncia diferencial de determinados alelos nas amostras resultou em grande divergncia gentica (Fst = 0,4914). As relaes de similaridade e dissimilaridade entre as amostras apresentam valores de identidade variando de 0,2249 a 0,9749. Estas foram organizadas em um dendrograma formando trs grupos, sendo dois formados por diferentes amostras coletadas no estado do Paran, So Paulo, Piau e Bahia e o terceiro grupo constitudo apenas por amostras coletadas no estado do Mato Grosso do Sul. As anlises forneceram uma percentagem de variao de 55% entre as amostras e, dentro destas, de 45%. As relaes genticas entre os gentipos individuais indicam, tambm, a formao de 3 grupos diferentes, com o isolamento do grupo composto pelos indivduos da regio Centro Oeste. Alm disso, o baixo valor obtido para o teste de mantel r2=0,06mostrou que a diferenciao entre as amostras no est relacionada distncia geogrfica que as separam. Os resultados obtidos neste trabalho sugerem um processo de especiao do gnero Cereus, sendo que as plantas que crescem nas quatro regies podem corresponder a diferentes espcies do gnero ou podem se tratar de um grupo em processo de especiao.

Abstract: Cereus is an ornamental cactus, popularly called "mandacaru" in Brazil, cultivated in gardens and in biological preservation areas. The species is ecologically, economically and industrially important due to the great variety of compounds it produces. This current research estimates the transferability of microsatellite markers of other cactus species to "mandacaru" and analyzes the specie's genetic variability establishing a relation of similarity or divergence between different samples grown in regions Northeast, South, Southeast and Central of Brazil. Thirty-three pairs of primers developed from different cactus species were evaluated for characterized the microsatellite markers. From the evaluation were selected ten pairs of primers developed from Polaskia chichipe, Ariocarpus bravoanus and Echinocactus grusonii giving a 30.30% transferability of these primers to "mandacaru'. Two of the microsatellites provided information for 2 loci, by this way were evaluated 12 microsatellite heterologous loci in 21 "mandacaru" samples. The polymorphism for the 21 samples reached 58,33%, evaluated loci showed 31 alleles at an average of 2.58 alleles per locus. Analysis of genotype frequency suggests a segregation distortion for 68 loci in which their frequency failed to present a Hardy-Weinberg equilibrium distribution. The average Fis value rate (0.0407) indicated a deficit of heterozygotes for the loci under analysis. Differential frequency of certain alleles in the different samples produced high genetic divergence (Fst = 0.4914) among them. Analyzes revealed greater genetic diversity between samples than within them, corroborating the intermediate gene flow (Nm = 0.2588). The relations of similarity and dissimilarity among the 21 samples ranged between 0.2249 and 0.9749, and produced a three-group dendrogram, two groups were made up from different samples collected in the state of Paran, So Paulo, Piau and Bahia whereas the third one was formed by samples collected in the state of Mato Grosso do Sul. The analysis provided a percentage variation between the samples of 55%, and within these 45%. The genetic relationships among individual genotypes also indicate formation of three different groups with the insulation from the group consisting for individuals from the region of Pantanal. The low values obtained for the test mantel r = 0.06 shows that differentiation between samples is not related to the geographical distance separating. The results obtained in this study suggest a process of speciation of the genus Cereus, so the plants that grow in the four regions in analyzes are plants that may correspond to different species of the grup in the process of speciation.
Data da defesa: 04/03/2013
Cdigo: vtls000218124
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2013
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Claudete Aparecida Mangolin
Instituio: Universidade Estadual de Maring . Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)/
UEM:

Responsavel: beth
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: VANESSA 13052014.pdf
Tamanho: 1632 Kb (1671216 bytes)
Criado: 03-10-2016 17:01
Atualizado: 03-10-2016 17:08
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