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Ttulo [PT]: Identificao e caracterizao genmica de um isolado do Bean rugose mosaic virus
Ttulo [EN]: Identification and genomic characterization of a Bean rugose mosaic virus isolate
Autor(es): marcelo Henrique Savoldi Picoli
Palavras-chave [PT]:

Bean rugose mosaic virus (BRMV). Sequenciamento completo. Bean rugose mosaic virus (BRMV). Identificao e caracterizao genmica. Comovirus. Fabaceae. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
Complete sequencing. Comovirus. Fabaceae. Brazil.
rea de concentrao: Proteo de Plantas
Titulao: Doutor em Agronomia
Banca:
Eliezer Rodrigues de Souto [Orientador] - UEM
Dauri Jos Tessmann - UEM
Adriana Gonela - UEM
Ione Parra Barbosa Tessmann - UEM
William Mrio de Carvalho Nunes - UEM
Tatsuya Nagata - UnB
Resumo:
Resumo: O Bean rugose mosaic virus (BRMV) considerado um membro do gnero Comovirus pertencente famlia Comoviridae, e que infecta espcies de leguminosas. O genoma completo deste vrus ainda no havia sido sequenciado. Os comovrus possuem duas fitas simples de RNA de senso positivo (RNA1 e RNA2), que so encapsulados separadamente em vrions esfricos. Um isolado viral inoculado mecanicamente em feijoeiro cultivar Rio Tibagi, induziu sintomas de mosaico, associados formao de bolhas e deformao foliar. Testes de ELISA indireto com anticorpos para comovrus de leguminosas foram positivos, e anlises de microscopia eletrnica de transmisso revelaram partculas icosadricas de aproximadamente 28 nm de dimetro em amostras foliares infectadas. Nos testes de transmisso com Diabrotica speciosa, a eficincia de transmisso foi de 40%. Anlises de transcrio reversa-reao em cadeia da polimerase (RT-PCR) sugeriram que o patgeno seria um comovrus, o que foi confirmado por anlises de partes do genoma sequenciadas. Das 29 cultivares de soja, 11 apresentaram sintomas, e das 22 cultivares de feijo, 17 desenvolveram sintomas quando inoculadas com o vrus. O genoma completo do isolado viral foi sequenciado, sendo constitudo de dois RNAs poliadenilados. O RNA1 composto de 5909 nucleotdeos, codificando um nico polipeptdeo com 1856 aminocidos, e massa molecular estimada em 210 kDa. A poliprotena do RNA1 contm os polipeptdeos necessrios para a replicao viral e para os processos proteolticos. O RNA2, com 3644 nucleotdeos, codifica um nico polipeptdeo de 1097 aminocidos contendo uma protena de movimento viral, e protenas dos capsdeos. As sequncias de nucleotdeos completas dos capsdeos virais (Small coat protein e Large coat protein) apresentaram identidade mxima de 54 e 61% com as sequncias de outras espcies de Comovirus. Este isolado foi identificado como BRMV-Paran, e com base nas sequncias obtidas e nos critrios estabelecidos pelo ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses), propomos que o BRMV seja considerado uma espcie distinta e definitiva do gnero Comovirus.

Abstract: The Bean rugose mosaic virus (BRMV) is a member of the genus Comovirus of the family Comoviridae, that infects leguminous plants. The complete genome of this virus had not yet been sequencenced. Comoviruses have two positive, single stranded genomic RNAs (RNA1 and RNA2), which are encapsidated into separate spherical virions. A virus isolate was mechanically inoculated in common bean cultivar Rio Tibagi, inducing symptoms of mosaic, blistering and leaf distortion. Indirect ELISA tests with antibodies for leguminous comoviruses were positives, and electron microscopic analysis revealed icosahedral particles approximately 28 nm in diameter in infected leaf samples. The virus transmission efficiency of Diabrotica speciosa was 40%. Reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis suggested the pathogen was a comovirus, as was confirmed after genomic partial sequencing. Eleven out of 29 soybean cultivars, and 17 out of 22 common bean cultivars showed symptoms after virus inoculation. The virus complete genome was sequenced consisting of two polyadenylated RNAs. RNA1 is 5909 nucleotides long encoding a single polypeptide of 1856 amino acids, with an estimated molecular weight of 210 kDa. The RNA1 polyprotein contains the polypeptides for viral replication and proteolytic processing. RNA2, that is 3644 nucleotides long, codes for a single 1097 amino acids polypeptide containing the movement protein and coat proteins. The complete nucleotide sequence of viral capsids (Small coat protein and Large coat protein) showed maximum identity of 54 and 61% with sequences from other Comovirus species. The isolate was identified as BRMV-Paran, and based on sequencing data and on ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses) criteria, we propose BRMV as a distinct and definitive species in the Comovirus genus.
Data da defesa: 03/02/2015
Cdigo: vtls000220796
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2015
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Eliezer Rodrigues de Souto
Instituio: Universidade Estadual de Maring . Centro de Cincias Agrrias . Programa de Ps-Graduao em Agronomia
Nvel: Tese (doutorado em Agronomia)/
UEM: Departamento de Agronomia

Responsavel: beth
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: TESE MARCELO H. S. PICOLI final.pdf
Tamanho: 1346 Kb (1378248 bytes)
Criado: 16-04-2016 10:45
Atualizado: 16-04-2016 10:58
Visitas: 332

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