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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

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Ttulo [PT]: Seleo de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) para o estudo da diversidade gentica em Euphorbia heterophylla L
Ttulo [EN]: Selection ISSR markers (Inter Simple Sequence Repeat) for the study of genetic diversity in Euphorbia heterophylla L
Autor(es): Dbora da Silva
Palavras-chave [PT]:

Amendoim bravo (Euphorbia heterophylla). Marcador molecular. Euphorbia heterophylla. Marcadores ISSR. Gentica de populaes. Brasil.
Palavras-chave [EN]:
ISSR markers. Population genetics. Wild poinsettia. Brazil.
rea de concentrao: Gentica e Melhoramento
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Claudete Aparecida Mangolim [Orientador] - UEM
Fernando Storniolo Adegas - EMBRAPA
Rubem Silvrio de Oliveira Jnior - UEM
Maria de Ftima Pires da Silva Machado - UEM
Resumo:
Resumo: A espcie Euphorbia heterophylla L. popularmente conhecida no Brasil como amendoim-bravo ou leiteiro, sendo uma das plantas daninhas mais importante da cultura da soja e que afeta a produtividade de cerca de muitas culturas anuais e perenes em vrios pases. A importncia do estudo dessa espcie se deve sua frequente presena como invasora em culturas de grande importncia econmica, como soja, milho e cana-de-acar. A avaliao da diversidade gentica e o entendimento da estrutura de gentica de populaes so elementos importantes para identificar formas de manejo e para orientar o desenvolvimento de planos efetivos de controle das plantas daninhas. Frente importncia do controle desta daninha, o objetivo no presente estudo foi padronizar as reaes e selecionar marcadores ISSR para avaliar a diversidade gentica em 132 amostras de leiteiro, coletadas em oito regies do Paran, uma regio do Rio Grande do Sul e uma de So Paulo, para verificar como estas populaes esto geneticamente estruturadas. Dos 30 primers de ISSR avaliados, apenas nove amplificaram o DNA das 132 amostras de E. heterophylla. Em nvel populacional, foi observada uma ampla diversidade gentica. O polimorfismo mdio nas sequncias ISSR foi de 98,50%, sendo maior para as plantas da amostra coletada em Pato Branco II (87,97%) e menor para a populao de Pato Branco I (33,83%), ambas coletadas no estado do Paran. A diversidade gentica de Nei (He) e o ndice de Shannon variaram de 0,1335 a 0,3800 e de 0,1948 a 0,5462, respectivamente, indicando que as amostras de leiteiro analisadas so geneticamente divergentes. A diversidade total (Ht) avaliada para todas as plantas dos 10 locais de coletas foi 0,3611 e o nvel de divergncia gentica (GST) foi alto (0,3607). Os valores altos para diversidade total e coeficiente de diferenciao representam a grande variao para alguns segmentos de ISSR, indicando que as amostras coletadas nas diferentes regies formam amostras geneticamente divergentes. A anlise do polimorfismo realizada utilizando a estatstica bayesiana indicou que as plantas das 10 localidades foram agrupadas em seis grupos ancestrais. Algumas amostras apresentaram predomnio de grupos de alelos e outras compartilham alelos de cinco ou de seis grupos, conferindo uma varincia molecular alta dentro das amostras avaliadas. Este resultado tambm foi evidenciado pela anlise da AMOVA, que indicou que 68% da variao gentica total esto presentes dentro das amostras, enquanto a variao entre as amostras foi de 32%. O valor de identidade e similaridade gentica estimado pelo mtodo de agrupamento UPGMA mostrou que as amostras de Jandaia I e Jandaia II so as mais similares (I = 0,9416) e que as amostras de Pato Branco I e Pato Branco II so as mais divergentes (I = 0,6915). As amostras avaliadas formaram um grande grupo, no fazendo parte deste agrupamento somente a amostra de Pato Branco III. O intervalo dos valores de identidade gentica estimados entre 0,6915 e 0,9416 indica ampla base gentica para as 10 amostras de E. heterophylla coletadas. O resultado do agrupamento mostra que a divergncia gentica independente da distncia geogrfica. Desta forma, as amostras de leiteiro analisadas no presente estudo, apresentando diversidade gentica alta em nvel molecular, podem ser de populaes fundadoras que contm marcadores ISSR diferenciados e formam populaes geneticamente estruturadas. Os nove marcadores ISSR identificados no presente estudo podero ser usados para monitorar efeitos de tipos e/ou doses diferentes de herbicidas sobre o genoma de leiteiro, como fatores determinantes ou no determinantes da estrutura de populaes de E. heterophylla.

Abstract: The species Euphorbia heterophylla L., popularly known as milkweed (amendoim-bravo and leiteiro in Brazil), is one of the most important weeds in soybean culture and affects the productivity of many annual and perennial crops in several countries. Studies on the species are especially due to its frequent invading factor in economically important crops such as soybeans, corn and sugar cane. The assessment of genetic diversity and knowledge of population genetics structure are important factors to identify types of management and to guide the development of effective planning in weed control. Owing to the relevance of the weed control, current study standardized reactions and selected ISSR markers to assess the genetic diversity in 132 samples of Euphorbia harvested in eight regions of the state of Paran, Brazil, and a single region of the state of Rio Grande do Sul, and of the state of So Paulo, Brazil, to investigate how these populations were genetically structured. In a total of 132 samples of E. heterophylla, thirty ISSR primers were evaluated and only nine had their DNA amplified. A wide genetic diversity was reported at population level; average polymorphic ISSR sequences was 98.50%, with highest rates in plants collected in Pato Branco II (87.97%) and with lowest rates in plants collected in Pato Branco I (33.83%), both in the state of Paran. Neys genetic diversity (He) and Shannons index ranged between 0.1335 and 0.3800 and between 0.1948 and 0.5462, respectively. The above showed that the samples of milkweed analyzed are genetically divergent. Total diversity (Ht) for all plants collected from 10 sites was 0.3611, whilst the level of genetic divergence (GST) was high (0.3607). Since high total diversity and differentiation coefficient rates demonstrated the great variation for some ISSR segments, this fact indicated that the samples collected in different regions comprised genetically divergent samples. Polymorphism analysis with Bayesian statistics indicated that plants from the 10 localities were grouped into six ancestral groups. Some samples showed a predominance of groups of alleles and other shared alleles with five or six groups. The above provided a high molecular variance within the samples evaluated. The same result was also given by the AMOVA analysis, which indicated that 68% of the total genetic variation occurred in the samples, whereas the variation between samples reached 32%. The identity and genetic similarity rates estimated by the UPGMA grouping method showed that samples Jandaia I and Jandaia II were the most similar (I = 0.9416), and the samples of Pato Branco I and Pato Branco III were the most divergent (I = 0.6915). The samples evaluated formed a large group, with the exception of sample from Pato Branco III. The estimated genetic identity rates ranged between 0.6915 and 0.9416, and indicated a broad genetic base for the ten E. heterophylla samples collected. Results show that genetic divergence is independent of geographic distance. Consequently, samples of milkweed analyzed in current study with high genetic diversity at the molecular level may be founder populations containing different ISSR markers and forming genetically structured populations. The nine ISSR markers identified in current analysis may be used to monitor effects of types and/or different doses of herbicides on the milkweed genome and as determinant or non-determinant factors of E. heterophylla population structure.
Data da defesa: 11/07/2014
Cdigo: vtls000223360
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2014
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Claudete Aparecida Mangolim
Instituio: Universidade Estadual de Maring . Centro de Cincias Agrrias
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)/
UEM: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Responsavel: beth
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: m-dsilva.pdf
Tamanho: 6186 Kb (6334156 bytes)
Criado: 02-09-2016 14:27
Atualizado: 02-09-2016 14:49
Visitas: 308
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