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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

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Ttulo [PT]: Avaliao da estabilidade gentica da uva cultivar itlia (Vitis Vinifera L.)
Ttulo [EN]: Evaluation of the genetic stability in grape of cultivar Italia (Vitis vinifera L.)
Autor(es): Danuza kelly Strioto
Palavras-chave [PT]:

Uva Itlia (vitis vinifera L.), (Vitaceae) estabilidade e variabilidade gentica, Marcadores moleculares em vitis, Microssatlites ou marcadores SSR em vitis, Uva Itlia (vitis vinifera L.), (Vitaceae), Estabilidade e variabilidade gentica, Marcadores moleculares em vitis, Marcadores ISSR (inter simple sequence repeats) em vitis, Uva, Cultivar itlia, Uva, Cultivo, Brasil, Viticultura, Variedades vegetais, Brasil, Uva, Cultivares - Brasil
Palavras-chave [EN]:
Vitis vinifera L.; cultivar Italia; microsatellites; ISSR; genetic stability. - Brazil
rea de concentrao: Gentica e Melhoramento
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Claudete Aparecida Mangolin [Orientador] - UEM
Sergio Ruffo Roberto - UEL
Dauri Jos Tessmann - UEM
Resumo:
Resumo: O gnero Vitis L. bastante diverso e se encontra distribudo pelas regies temperadas e subtropicais do mundo. Dentro da espcie Vitis vinifera L., temos a cultivar Itlia, obtida por meio do cruzamento de Bicane com Moscatel de Hamburgo. Apesar das uvas da cultivar Itlia serem propagadas vegetativamente a ocorrncia de mutaes somticas parece ser um evento frequente, promovendo alta variabilidade gentica. A proposta do presente estudo foi avaliar a estabilidade gentica da cultivar Itlia, estudando duas classes diferentes de sequncias de DNA, os microssatlites, tambm chamados de sequncias simples repetidas (SSR), e as regies que esto entre as sequncias simples repetidas (ISSR), de amostras coletados em trs propriedades do municpio de Marialva e de uma propriedade do municpio de Sarandi-PR. Para avaliar as primeiras sequncias, foram utilizados 13 pares de primers. Para estes locos estudados, observamos 27 alelos (2,08 alelos/loco) e as evidncias so de um nmero reduzido de alelos. O polimorfismo obtido para as amostras estudadas com SSR foi de 61,54%. Os parmetros de diversidade gentica apontam para um aumento de heterozigotos nas amostras dos quatro acessos da cultivar Itlia (valores negativos de FIS foram observados para 8 dos 13 locos analisados), o valor mdio do FIS foi de -0,3404. O valor de FST foi de 0,0688, indicando moderada diferenciao entre os acessos. Os valores de similaridade gentica variaram de 0,8516 (entre os acessos 2 e 4) a 0,9884 (entre os acessos 1 e 3). A anlise das sequncias SSR possibilitou a discriminao entre as amostras da cultivar Itlia e foi possvel constatar que as amostras desta cultivar se mantm geneticamente estveis. Para o estudo das sequncias ISSR, foram utilizados 14 primers, os quais amplificaram 135 segmentos de DNA. O polimorfismo obtido para este marcador foi de 80%. Apesar do alto polimorfismo, as relaes de similaridade e de distncia gentica de Nei entre os quatro acessos apontam para uma baixa diferenciao entre eles, sendo que os valores de similaridade variaram de 0,9503 (entre os acessos1 e 4) a 0,9801 (entre os acessos 2 e 3). O valor de similaridade gentica calculado por meio do coeficiente de Jaccard para as 57 amostras da cultivar Itlia variou de 0,8358 a 1,0000. Para os dois marcadores, tambm foi realizada uma anlise bayesiana e os resultados desta anlise indicam que as 57 plantas dos quatro acessos foram organizadas em 3 grupos diferenciais de alelos. Os resultados de nosso estudo apontam que a cultivar Itlia tem se mantido geneticamente estvel. Este fato pode ser constatado pelo nmero de alelos observados em anlise realizada em 2006 (2,12 alelos) e em 2012 (2,08 alelos). Com os nossos resultados, pode-se constatar que o marcador SSR possibilitou discriminar os quatro acessos da cultivar Itlia, contrariando as evidncias de que os marcadores microssatlites no so adequados para discriminar amostras geneticamente muito similares e que, apesar do alto polimorfismo presente nas sequncias ISSR, este marcador apontou para uma baixa discriminao para as plantas dos quatro acessos coletados

Abstract: The genus Vitis L. is not only highly diverse but is also distributed in many temperate and subtropical regions. The cultivar Italia (Vitis vinifera L.) by cross-breeding between Bicane and Moscatel de Hamburgo. Although grapes of the cultivar Italia are vegetally propagated, somatic mutations are rather frequent, with great genetic variability. Current research evaluated the genetic stability of the cultivar Italia by analyzing two different classes of DNA sequences, namely, the microsatellites or simple repeated sequences (SSR), and the regions between the simple repeated sequences (ISSR) of samples collected in three plantations in the municipality of Marialva and one in Sarandi PR Brazil. The first sequences were evaluated by using 13 pairs of primers. Loci studied registered 27 alleles (2.08 alleles/locus) and evidence of a reduced number of alleles. Polymorphism of the samples under analysis with SSR was 61.54%. Genetic diversity parameters indicated an increase of heterozygotes in the samples of the four accesses the cultivar Italia (negative rates of FIS were reported for 8 out of the 13 loci analyzed), with mean rate of FIS as -0.3404. Since FST rate was 0.0688, a moderate differentiation between accesses was indicated. Genetic similarity rates varied between 0.8516 (between accesses2 and 4) and 0.9884 (between accesses 1 and 3). The analysis of SSR sequences discriminated samples of the cultivar Italia and established the genetic stability of the samples of this cultivar. Fourteen primers were used for the study of ISSR sequences which amplified 135 DNA segments. The polymorphism for this marker was 80%. In spite of this high polymorphism, relationships of similarity and Nei genetic distance between the four accesses indicate low differentiation, with similarity rates ranging between 0.9503 (between accesses 1 and 4) and 0.9801 (between accesses 2 and 3). Genetic similarity rates calculated by the coefficient of Jaccard for 57 samples of the cultivar Italia ranged between 0.8358 and 1.0000. A Bayesian analysis performed for the two markers showed that the 57 plants of the 4 accesses were organized into 3 allele differential groups. Results show that the cultivar Italia has maintained itself genetically stable, provided by the number of alleles in 2006 (2.12 alleles) and in 2012 (2.08 alleles). With our results we cansee that the marker SSR allowed to discriminate the four accesses the cultivar Italy, contrary to the evidence that microsatellite markers are not suitable to discriminate genetically very similar samples, and that despite the high polymorphism present in ISSR sequences, this marker pointed to a low discrimination for plants of the four accesses collected
Data da defesa: 28/02/2014
Cdigo: vtls000223823
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2014
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Claudete Aparecida Mangolin
Instituio: Universidade Estadual de Maring. Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)
UEM:

Responsavel: luiz
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: Dissertao aprovada e encadernada - Danuza.pdf
Tamanho: 1540 Kb (1577351 bytes)
Criado: 27-09-2016 08:09
Atualizado: 27-09-2016 08:16
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