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Consultar: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

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Ttulo [PT]: Sequenciamento de isolados da raa 65 de Colletotrichum lindemuthianum utilizando as regies ITS
Ttulo [EN]: Sequencing of isolates of Colletotrichum lindemuthianum race 65 using the ITS regions
Autor(es): Marcela Colho
Palavras-chave [PT]:

Fungo Colletotrichum lindemuthianum. Gentica molecular de microorganismo. Antracnose. Dissimilaridade gentica. Variedade gentica.
Palavras-chave [EN]:
Anthracnose. Genetic dissimilarity. Genetic variability. Brazil.
rea de concentrao: Gentica e Melhoramento
Titulao: Mestre em Gentica e Melhoramento
Banca:
Maria Celeste Gonalves Vidigal [Orientador] - UEM
Claudia Tomasella
Lorenna Lopes de Sousa
Giselly Figueiredo Lacanallo
Resumo:
Resumo: A antracnose, causada pelo fungo Colletotrichum lindemuthianum (Sacc e Magnus) Briosi e Cavara, uma das doenas mais severas que atacam o feijo comum no mundo. Uma das medidas mais eficientes para controlar esta doena a utilizao de cultivares resistentes, porm o surgimento de novas raas fisiolgicas do fungo C. lindemuthianum representa um desafio para a utilizao desta estratgia. Dentre as raas de C. lindemuthianum j relatadas, a raa 65 merece destaque, por ter sido identificada em vrios pases, incluindo o Brasil. Alm disso, h registros de que isolados da raa 65, provenientes de diferentes localidades, apresentam variabilidade gentica. Uma das tcnicas para estudar a variabilidade gentica em fitopatgenos envolve o sequenciamento das regies ITS (Internal Transcribed Spacer) do DNA ribossmico (rDNA). Desta forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar isolados de C. lindemuthianum da raa 65, provenientes de diversas regies do Brasil, por meio do sequenciamento de regies ITS. Um total de 17 isolados da raa 65, coletados nos estados do Mato Grosso, Minas Gerais, Paran, Santa Catarina e So Paulo, foram estudados. Os resultados revelaram a existncia de elevada variabilidade gentica entre e dentro da raa 65. As anlises das sequncias dos 17 isolados da raa 65 apresentaram 11 SNPs nas regies ITS, sendo que, na regio ITS1, foram identificados 6 SNPs e, na regio ITS2, 5 SNPs. A maior dissimilaridade gentica foi observada entre os isolados 10 e 11, provenientes de Santa Catarina e, entre os isolados 3 e 11, do estado de Mato Grosso e Santa Catarina, respectivamente, cuja magnitude foi de 0,772. Por sua vez, os isolados mais similares foram o 2 e 7, com valor de distncia gentica de 0,002, os quais so oriundos do Mato Grosso e Santa Catarina, respectivamente. A rvore filogentica obtida com base nas sequncias das regies ITS1 e ITS2 revelou a formao de dois grupos bem definidos (Grupo I e II). O grupo I foi formado por 2 isolados provenientes de Santa Catarina e 1 isolado de cada um dos estados do Mato Grosso, So Paulo e Paran. O grupo II apresentou a formao de dois subgrupos, sendo um deles formado por 6 isolados de Santa Catarina, 3 isolados de So Paulo, 2 do Mato Grosso e 1 isolado de Minas Gerais, enquanto o segundo subgrupo foi composto por 1 isolado de Santa Catarina.

Abstract: Anthracnose, caused by Colletotrichum lindemuthianum (Sacc and Magnus) Briosi and Cavara, is one of the most severe fungal diseases that attack common bean. An effective method to control anthracnose in common bean is to use resistant cultivars, but the emergence of new physiological races of C. lindemuthianum is a challenge to implement this strategy. Among the C. lindemuthianum races, the race 65 stands out for having been identified in several countries, including Brazil. In addition, there are several records that isolates of race 65 from different locations, present genetic variability. One of the techniques to study genetic variability in pathogens involves the sequencing of ITS regions (Internal Transcribed Spacer) of the ribosomal DNA (rDNA). Thus, the objective of this study was to characterize isolates of C. lindemuthianum race 65 from different regions of Brazil, through the sequencing of ITS regions. A total of 17 isolates of race 65, collected in the states of Mato Grosso, Minas Gerais, Paran, Santa Catarina and So Paulo were studied. The results revealed the existence of high genetic variability among and within the race 65. The sequence analysis of 17 isolates of race 65 showed the presence of 11 SNPs (single nucleotide polymorphism) in the ITS regions. In the ITS1 region ware identified the presence of 6 SNPs, while in the ITS2, 5 SNPs were identified. The largest genetic dissimilarity was observed among isolates 10 and 11 from Santa Catarina state and among isolates 3 and 11 from Mato Grosso and Santa Catarina states, respectively, which value was 0.772. On the other hand, the most similar isolates were 2 and 7 (genetic distance of 0.002) collected in Mato Grosso and Santa Catarina states, respectively. The phylogenetic tree obtained from the ITS1 and ITS2 sequences, revealed the presence of two well-defined groups (Group I and II). Group I consisted of 2 isolates from Santa Catarina and 1 isolate each of the states Mato Grosso, So Paulo and Paran. Group II was composed of two subgroups, one being formed by 6 isolates from Santa Catarina, 3 isolates from So Paulo, 2 from Mato Grosso and 1 isolated from Minas Gerais, while the second subgroup consisted of 1 isolate from Santa Catarina.
Data da defesa: 27/12/2014
Cdigo: vtls000225761
Informaes adicionais:
Idioma: Portugus
Data de Publicao: 2014
Local de Publicao: Maring, PR
Orientador: Prof. Dr. Maria Celeste Gonalves Vidigal
Instituio: Universidade Estadual de Maring . Centro de Cincias Agrrias
Nvel: Dissertao (mestrado em Gentica e Melhoramento)
UEM: Programa de Ps-Graduao em Gentica e Melhoramento

Responsavel: edson
Categoria: Aplicao
Formato: Documento PDF
Arquivo: Dissertaao - Marcela Colho.pdf
Tamanho: 889 Kb (910228 bytes)
Criado: 25-05-2017 17:15
Atualizado: 25-05-2017 17:34
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